Trường được thành lập năm 1966 dưới tên Trường Trung cấp nghề Trung Đài , sau gần 39 năm hoạt động, trường được cho phép nâng cấp thành Trường cao đẳng Kỹ thuật Y và cuối cùng vào năm 2005, trường chính thức trở thành Trường Đại học khoa học và Kỹ thuật Trung Đài .
Sau khi trở thành trường đại học, CTUST được chia thảng 3 học viện và 1 viện trước đại học với 14 khoa cùng 11 viện cao học .
- Học viện khoa học y tế
- Khoa khoa học thí nghiệm y học và công nghệ sinh học
- Khoa khoa học hình ảnh
- Khoa công nghệ nha khoa và khoa học vật liệu
- Khoa khoa học và kỹ thuật thực phẩm
- Khoa an toàn sức khỏe và kỹ thuật môi trường
- Khoa thị lực
- Viện cao học về công nghệ sinh học và kỹ thuật y sinh
- Học viện điều dưỡng
- Khoa điều dưỡng
- Khoa chăm sóc người cao tuổi
- Chương trình thạc sĩ ngành chăm sóc lâu dài
- Học viện quản lý
- Khoa quản lý chăm sóc sức khỏe
- Khoa quản lý hệ thống thông tin
- Khoa quản lý marketing
- Khoa kinh doanh quốc tế
